Molte algie cranio-facciali sono attribuibili a sindromi mialgiche scatenate da alcuni muscoli correlati all'articolazione mandibolare, quali i masseteri, i temporali e gli pterigoidei.Alcuni fattori scatenanti sono da collegare a disarmonie masticatorie tra cui: una masticazione asimmetrica, la presenza di contatti occlusali precoci, il digrignamento notturno e i problemi derivanti dalla respirazione orale, evidenziabili attraverso vari test funzionali.
Conclusa la valutazione funzionale, che può essere completata con la visione radiologica dell'articolazione temporo-mandibolare, si passa al trattamento fisioterapico.